1、干货保存： 买后用保鲜盒或者密封保鲜袋可放到冰箱的保鲜或者冷藏格。或者彻底晾干后（但不可日光直射），放到通风阴凉无潮的地方。若因处理失当而发现燕窝有轻微发霉，可用牙刷加少许水分擦净，将之风干即可（切记不要太阳晒哦。严重影响质量）。注：若发现燕窝湿度大，即使打算放入冰箱保存也建议先风干。 若燕窝已发酶到变黑色，则不再食用，因为燕窝已经被细菌侵蚀，当中的营养成分亦已经丧失。燕窝乃是非常珍贵的食品，必须好好保存。

2、湿货保存（已经浸发）： 用干净的器皿盛装，密封，防生水，防油可以放在保鲜或者冷藏7-15天。最好是做到用多少，发多少，一次不要发太多，太透。因为已发制的燕窝会随着存放时间长短而造成一定程度上的营养流失。

3、浓缩保存： 燕窝在未开封之前贮存于冰箱的冷藏室，当打开之后请尽快食用完，若没有一次性吃完，也是存于冰箱冷藏室。 注：注意区分冷冻、冷藏室的区别。